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Structure tertiaire des protéines

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Structure tertiaire des protéines

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La forme tridimensionnelle d'une protéine est déterminée par sa structure primaire. L'ordre des acides aminés établit la structure et la fonction spécifique d'une protéine. Les instructions distinctes pour l'ordre des acides aminés sont désignées par les gènes dans une cellule. Plusieurs protéines sont formées de l'assemblage de plusieurs chaînes d'acides aminés. C'est le cas, par exemple, de l' hémoglobine, la protéine des globules rouges qui transporte l'oxygène. L'hémoglobine est formée de deux chaînes dites alpha (identiques l'une à l'autre) et de deux chaînes dites bêta. STRUCTURE TERTIAIRE DES PROTEINES : L'arrangement spatial des structures secondaires locales aboutit à une forme globale spécifique de la protéine maintenue par des interactions qui peuvent être de nature différente : -liaisons covalentes: ponts disulfures. La structure tertiaire et quaternaire des protéines Les protéines : sont des grosses molécules résultent de l'assemblage de plus de 100 acides aminés par des liaisons. Les protéines présentent différents niveaux structuraux au sein de l’organisme et jouent plusieurs rôles biologiques. La structure tertiaire d'une protéine correspond au repliement de la chaîne polypeptidique en trois dimensions. La structure tridimensionnelle d'une protéine est maintenue par différentes forces de cohésion: • les interactions covalentes comme les ponts disulfures entre les atomes de souffre des résidus cystéines. La structure tertiaire d'une protéine fait référence à l'organisation dans l'espace de ses structures secondaires. La structure en 3D adoptée par tous ces feuillets et toutes ces hélices est la structure tertiaire de la protéine. Protéines simples : ils sont constitués de résidus d'acides aminés. Lorsqu'elles sont hydrolysées, les protéines ne produisent que des acides aminés comme constituants. La protéine est en outre classée en: Protéine fibreuse : Kératine, Élastine, Collagène. Protéine globulaire : Albumine, globuline, glutéline, histones. Les chaînes latérales d' acides aminés peuvent interagir et se lier de plusieurs manières. Afin de pallier ce défaut, des méthodes automatiques de prédiction de la structure tertiaire des protéines ont été développées. Il se dégage deux types de méthodes : Les méthodes basées sur les structures des protéines connues : Les méthodes par homologie; Les méthodes par reconnaissance des repliements (Protein Threading). La structure tridimensionnelle globale d'un polypeptide s'appelle la structure tertiaire. La structure tertiaire est principalement due aux interactions entre les groupes R des acides aminés qui composent la protéine. La structure primaire correspond à la séquence en acides-aminés de la protéine. La structure secondaire est relative au premier niveau de compaction des protéines ; deux structures sont observées : les hélices α (alpha) et les feuillets β (bêta). La structure tertiaire correspond à la compaction des structures secondaires entre elles. Biochimie des protéines BCM514. On distingue quatre niveaux stades structuraux chez les protéines, de la structure primaire à la structure quaternaire. (1) Structure primaire: ordre des acides aminés le long de la chaîne polypeptidique. La structure primaire est la formation et l’ordre différents dans lesquels les acides aminés (les éléments constitutifs) se mélangent et se lient pour nous donner une molécule de protéine. La protéine tire toutes ses propriétés de sa structure primaire. Chaque protéine détermine par le séquençage des acides aminés. Introduction aux protéines et acides aminés. Aperçu de la structure des protéines. Structure tertiaire des protéines. 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